Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYSRT1A8MQ03 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms