Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ3A6PVS8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ3A6PVS8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms