Protein–RNA interactions for Protein: A6NM62

LRRC53, Leucine-rich repeat-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC53A6NM62 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC53A6NM62 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC53A6NM62 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms