Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MAP1LC3B2A6NCE7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms