Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSDA5PKW4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms