Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ADGRG1-214ENST00000562558 3858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 TMEM156-203ENST00000381938 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 EXOC6-202ENST00000371543 2714 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 HBD-201ENST00000292901 486 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 SAA1-201ENST00000356524 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 PLP2-202ENST00000376327 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 SNX31-202ENST00000428383 1265 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AC103563.6-201ENST00000432787 295 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 ATF4P4-202ENST00000438498 1049 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AC074351.1-201ENST00000439413 481 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AL590822.1-201ENST00000442483 326 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 RN7SL648P-201ENST00000478418 301 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 CARMN-203ENST00000509909 592 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 CLDN24-201ENST00000514470 663 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AC079054.1-201ENST00000523090 331 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AC093496.1-201ENST00000525575 613 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 CLDN24-202ENST00000541814 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AP000851.1-201ENST00000544115 743 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 PYM1-207ENST00000557259 775 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AC019254.2-201ENST00000560938 556 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AC022748.2-201ENST00000569846 568 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 ZNF213-AS1-210ENST00000576590 541 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AP005208.1-201ENST00000582863 208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 MAP3K14-AS1-207ENST00000588698 460 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AL353770.4-202ENST00000621296 1126 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 BX005040.1-201ENST00000622281 1126 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 SALRNA3-201ENST00000630100 1021 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AP002383.4-202ENST00000639030 657 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 IGSF3-202ENST00000369483 7326 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 HADHA-201ENST00000380649 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 SERPINA5-205ENST00000554276 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 SERPINA5-208ENST00000554866 2211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 PCDHGB6-201ENST00000520790 4599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AC040160.1-201ENST00000573063 2677 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 TMEFF2-202ENST00000392314 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AFMID-202ENST00000409257 1730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 SNX6-201ENST00000362031 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 ADAM21P1-202ENST00000530196 2049 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 AC068831.1-202ENST00000557804 2159 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 MAST2-203ENST00000372009 4047 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 BTN2A3P-203ENST00000465856 2483 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 EIF3CL-202ENST00000398944 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 BRINP1-201ENST00000265922 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO3Q8TAP4 PCDHGC3-201ENST00000308177 4725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 TTC8-205ENST00000358622 2297 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 LINC01140-210ENST00000590653 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ITGA7-203ENST00000452168 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 OR10H5-202ENST00000642092 7044 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 CCDC14-207ENST00000433542 3260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 DDX31-205ENST00000438527 2814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 DNASE1L3-206ENST00000483681 2099 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PRAMEF13-201ENST00000625019 1606 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PKP1-201ENST00000263946 5447 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PHC1P1-201ENST00000554937 3061 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ZFP36L1-204ENST00000555997 3094 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC018512.1-201ENST00000417761 2326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC027045.3-201ENST00000635215 2884 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 TIAM2-212ENST00000529824 5262 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 REG3G-201ENST00000272324 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC089987.2-201ENST00000328207 936 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 KRTAP26-1-201ENST00000360542 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 SOD2-203ENST00000367055 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 HIST1H2BPS1-201ENST00000369177 310 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 CNN2P4-201ENST00000396461 904 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 RCC2P7-201ENST00000405832 1264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC245052.2-201ENST00000413723 327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC016747.1-203ENST00000422740 595 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 NPC2-202ENST00000434013 875 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC011290.2-201ENST00000438427 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 CCT6P1-203ENST00000443108 1170 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 POLR2H-205ENST00000443489 807 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC095041.1-201ENST00000472309 591 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 LHX6-206ENST00000482062 918 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 YWHAQP6-201ENST00000508556 304 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC007992.1-201ENST00000513953 953 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AL132708.1-201ENST00000536735 568 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC021818.2-201ENST00000560960 731 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC106779.1-201ENST00000561663 1018 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 BOLA2P2-201ENST00000603861 250 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ANKRD20A2-203ENST00000611747 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ANKRD20A4-203ENST00000615302 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC092329.4-210ENST00000639997 752 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC092329.4-209ENST00000640920 924 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PGLYRP4-201ENST00000359650 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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