Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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ARL2-SNX15V9GYD0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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