Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN4Q9Y3Q4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms