Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THRAP3Q9Y2W1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THRAP3Q9Y2W1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THRAP3Q9Y2W1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms