Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC5Q9UQL6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms