Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN8AQ9UQD0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN8AQ9UQD0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCN8AQ9UQD0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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