Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TRAK1Q9UPV9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAK1Q9UPV9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms