Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
L1RE1Q9UN81 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms