Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP18Q9UMW8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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