Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC7AQ9ULT0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms