Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms