Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA2Q9UL42 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA2Q9UL42 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms