Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBE1Q9UJT0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBE1Q9UJT0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms