Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATPIF1Q9UII2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATPIF1Q9UII2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATPIF1Q9UII2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATPIF1Q9UII2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATPIF1Q9UII2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATPIF1Q9UII2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATPIF1Q9UII2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATPIF1Q9UII2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATPIF1Q9UII2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATPIF1Q9UII2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms