Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF639Q9UID6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF639Q9UID6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms