Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPC1L1Q9UHC9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms