Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCF2Q9UG63 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms