Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN8Q9UBY8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms