Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XCL2Q9UBD3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XCL2Q9UBD3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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