Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SIPA1L2Q9P2F8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIPA1L2Q9P2F8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms