Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHPF2Q9P2E5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms