Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNRD1Q9P1U0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRD1Q9P1U0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms