Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COX16Q9P0S2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms