Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF12Q9NZN5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
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