Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM53CQ9NYF3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM53CQ9NYF3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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