Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFT57Q9NWB7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFT57Q9NWB7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT57Q9NWB7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms