Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3AQ9NVI7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3AQ9NVI7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms