Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBRD1Q9NUN5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD1Q9NUN5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms