Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM106BQ9NUM4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM106BQ9NUM4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms