Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PDS5BQ9NTI5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PDS5BQ9NTI5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms