Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS45Q9NRW7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VPS45Q9NRW7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms