Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR8Q9NR97 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR8Q9NR97 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms