Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM7Q9NQW5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM7Q9NQW5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms