Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA8Q9NP80 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA8Q9NP80 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms