Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSU72Q9NP77 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSU72Q9NP77 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SSU72Q9NP77 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSU72Q9NP77 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms