Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUFT1Q9NNX1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms