Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF2Q9HAK2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF2Q9HAK2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms