Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB6CQ9H0N0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB6CQ9H0N0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms