Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTDSP1Q9GZU7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms