Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LNPKQ9C0E8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms