Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2OQ9C0C9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms