Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNTNAP4Q9C0A0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms