Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM3Q9BZQ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM3Q9BZQ6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms