Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM55Q9BYV6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM55Q9BYV6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms