Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GSDMCQ9BYG8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GSDMCQ9BYG8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms